Отбор и исследование проб воды по санитарно-химическим и микробиологическим показателям проводился на озёрах Белое, Новое, Рассошное, Кудьмозеро, Кородское, на реках Солза, Ширшима, Кудьма, Северная Двина, на Белом море, на четырёх рефулёрных озёрах в черте города. Также проводился отбор и исследование песка пляжной зоны о. Ягры.
На протяжении ряда лет наблюдений некоторые водоёмы обладают стабильно удовлетворительным качеством воды, другие же характеризуются неустойчивым качеством даже в пределах одного летнего периода. Наиболее чистым водоёмом является река Солза, которая расположена вдали от промышленных и сельскохозяйственных объектов и других источников техногенных загрязнений. Солза является источником централизованного водоснабжения Северодвинска. Превышений по содержанию химических веществ, бактериологическим показателям в речной воде не установлено.
По результатам исследований других водоёмов, установлено, что несколько из них не соответствуют нормам по ряду санитарно-химических и микробиологических показателей. Это - озёра: Кислое, на ул. Железнодорожной, на пр. Ленина; залив «Параниха» Белого моря, река Северная Двина. Также необходимо оградить себя от купания в таких водоёмах, как рефулёрное озеро Театральное, река Кудьма («грязный» створ реки).
Удовлетворительные оценки получили реки Кудьма («чистый» створ реки) и Ширшима, озёра Белое, Кудемское, Кородское, Рассошное, Белое море.
Роспотребнадзор рекомендует при купании в любом водоёме учитывать погодные условия, не употреблять алкоголь, не заглатывать воду, а по приходу домой принять душ.